b) Comment?

1) Cliquer sur "Result" au milieu :

2) Donner ensuite la matrice de la séquence.

3) SPM2 nous demande ensuite quel type de contraste on veut appliquer pour visualiser les résultats. Il en existe de deut types : Les F et les t.

Pour résumer, on utlisera :
- Un contraste de type F (test de Fischer) pour tester et éventuellement améliorer le modèle, comparer les conditions modélisées, ou tester l'interaction ente différentes conditions.
- Un contraste de type t (test de Student) pour tester, dans chaque voxel du cerveau (à l'intérieur du masque d'analyse) si l'activation associée à une condition donnée est plus grande que celle associée à une autre condition ; ou si l'activation associée à un groupe de condition est plus grande que celle associée à un autre groupe.

SPM2 dans cette fenêtre nous dresse la liste des paradigmes. Il y a tous ceux qui ont été défini dans l'étape 3 plus un par défaut que le programme créé tout seul : "effect of interest" correspondant à toutes les activations de la séquence.

En haut on peut séléctionner le type de contraste que l'on désire voir figurer dans la liste : ceux de type F, ceux de type t ou tous.

En cliquant sur "Define new contrast" on peut créer soi-même un contraste pour tester une hypothèse cognitive : Un chapitre spécial en annexe est dédié à la création de contrastes. (Annexe 1 et Annexe 2)

4) On séléctionne le contraste que l'on veut tester et on clique sur "Done".

5) SPM2 demande si on veut appliquer d'autres contrastes, ceci sert à faire une addition ou une soustraction dez zones d'activations définies par plusieurs contrastes :

- Si l'on clique sur "yes" on doit choisir ensuite l'autre contraste à implémenter. Puis on doit choisir si ce nouveau contrast doit être appliqué de manière "Inclusive" (Addition des zones d'activation) ou "exclusive" (Soustraction des zones d'activation).

- Si on clique sur "No" on passe directement au 6).

6) On donne ensuite un titre pour cette analyse.

7) Cliquer ensuite sur "FWE" et spécifier une valeur de seuil "p". En général cette valeur sera de 0.05.

8) "&extend treshold" permet de spécifier des foyers d'activations d'un certain nombre de voxels. Si l'on veut conserver les voxels isolés on met la valeur 0.

9) SPM2 affiche dans la fenêtre graphique une vue appelée "Brain Glass" : Ce sont 3 vues du cerveau (Sagittale, Coronale et axiale) sur lesquelles sont projettées en niveau de gris les zoens d'activation.